ネコはそれぞれ、他のネコに対して「安心できる距離」というものを持っています。ネコ同士の仲が悪いのは、想定している「安心できる距離」以上にお互いが近づいてしまい、不安を強く感じたためです。

仲良くしてもらう方法としては、まず食事を与える際に壁などを挟んで、お互いがまったく見えない状態とします。
また、絶対に相手のネコがこちらにやって来ない状態にして大丈夫であることを教えます。
そうすることで、お互いの存在に少しずつ慣れさせます。
その状態に慣れてきたら、同じ部屋の中でも端と端で食事を与えるなどして日に日にほんの少しずつ距離を縮めていきましょう。
これは、とても根気のいる作業です。ゆっくりとあせらずに取り組んでください。それぞれのネコが安心できるように隠れられる場所もたくさん用意してあげましょう。
無理に仲良くさせようと急に距離を縮めたりすると、余計にこじらせてしまう場合がありますのでご注意ください。

ネコはもともと単独生活をしていた動物のため、本能的に独りになりたいという欲求を持っています。
ですから、それが叶わないことでネコはリラックスできていないかもしれません。

ネコにとって独りで隠れることのできる専用の場所は、気持ちの落ち着く安心できる場所となります。
専用の隠れ場所をつくってあげることで、ネコがリラックスして過ごせるようにしてあげましょう。
ネコ専用の隠れる場所は、いつも食事を与えている部屋や、よく眠っている部屋などにつくってあげると良いでしょう。
できれば、高いところのほうがネコは好むでしょう。
そのネコ自身の匂いがついたモノを置いてあげたり、大好きなオヤツをそこで与えるようにすれば、その場所がだんだん好きになっていきます。